首先，商品条码的申请费用是根据申请机构的规定而定的。在国内，申请商品条码主要有两个机构，一个是国际商品编码协会中国区分会（简称GS1中国），一个是国家条码中心。由于GS1中国是国际商品编码协会的中国代表机构，其条码标准规范性较高，因此国内大部分企业选择在GS1中国申请商品条码。目前GS1中国的商品条码申请费用为2000元一次性缴纳，同时还需要缴纳每年500元的维护费用。

其次，商品条码的费用也与商品类别有关。一般来说，不同的商品类别对应着不同的条码规格和标准，因此申请费用也存在差异。例如，药品的条码规格应当符合国家药品监管部门的标准，因此药品条码的申请费用比较高，一般在5000元左右。而对于普通的日用品、食品等，申请费用则相对较低，一般在2000元左右。

除了以上因素外，商品条码申请的费用还与申请数量有关。不同的企业有不同的需求，可能需要申请一种或多种商品条码，因此申请费用也有所不同。一般来说，申请数量越多，单价越低，但总费用也相应增加。

商品条码是企业管理和商品流通的重要工具，但申请费用较高，对于中小企业和初创企业来说，有一定的经济压力。因此，一些企业也会选择采用没有唯一性的自行设计条码，但这种做法会导致商品信息难以追溯，影响消费者和企业之间的信任关系，因此不被推荐。

综上所述，商品条码申请费用与多种因素有关，企业在申请前需要根据自身需求和经济能力进行综合考虑，选择最合适的申请机构和规格标准。同时，建议企业合理规划申请数量和时间，有效降低申请费用，提高经济效益和管理效率。